ميرحسين قرار گرفتن زير چتر خاتمي را رد کرد. 
 ميرحسين حاضر به قبول پيشنهاد اعضاي اين مجمع براي وحدت و قبول رهبريت جريان اصلاحات با محوريت خاتمي را رد کرده است.
به گزارش جهان به نقل از رسالت  وي در پاسخ به سئوال نمايندگان مجمع محققين که براي آينده جريان اصلاحات چه پيشنهادي داريد؟ گفت: من حاضرم ميزبان شوم و حرکت هاي آينده را ترسيم کنيم به شرط اينکه خارج از چارچوب عمل نشود. اين حرف که فلان آقا زماني محور جريان اصلاح طلبان بوده پس ما هم بايد زير چتر او برويم و او رهبر جريان شود را من قبول ندارم. ميرحسين با گلايه از بي مهري هايي که برخي افراد مطرح جريان اصلاحات به او کرده اند گفته است: برخي از آقاياني که شما آنها را به رخ ما مي کشيد طي ماه هاي اخير جز چوب لاي چرخ گذاشتن کاري نکرده اند و حتي يکبار حاضر نشدند از عبارت جنبش سبز نامي ببرند و در جلسات خصوصي چه بد و بيراه ها که به ما نگفتند. موسوي در اين جلسه با انتقاد شديد از بعضي پدر بزرگان مدعي اصلاحات گفته است من به خاطر اينکه اختلافات به بيرون درز نکند و طرفداران دلسرد نشوند خيلي از حرف ها را نمي زنم و گرنه گلايه زياد است.
 ميرحسين با ابراز ناراحتي از عناصر خودي نزديک به اصلاحات گفته است من آن قدر که از خودي ها ضربه خوردم از طرف مقابل نخوردم، عده اي از افراد در اين حوادث جا زدند وبعضي هم معامله کردند و يک عده هم به خاطر حسادت به من ضربه زدند!